تشمل أجندة المؤتمر الوطني للشباب كافة المجالات التي تحظى بأهمية كبيرة لدى المجتمع المصري عامة و لدى شباب وقادة المستقبل خاصة لتضم البعد الاجتماعي – البعد الاقتصادي- البعد البيئي والبعد السياسي ويتم طرح القضايا المختلفة في جلسات عامة وفرعية يشارك بها الشباب بطرح رؤيتهم وأرائهم حول مختلف الموضوعات والقضايا التي تحظى باهتمام المجتمع المصري إلى جانب العديد من ورش العمل العامة والفرعية.